PERL

Los módulos de CPAN, PPM y Bioperl.

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Por Rubén Fernández
Todos sabemos; los que un punto u otro hemos escrito un programa, desde el más trivial hasta el más complejo de ellos,desde los más experimentados programadores hasta los menos, que no hay punto en “reinventing the wheel” cuando podemos usar un código ya bien desarrollado por otros. Esta máxima aplica a cualquier lenguaje de programación y de alguna manera es un principio metodológico en el área de desarrollo de software. PERL no escapa a esta máxima, existen repositorios que contienen codigos muy bien probados y reusables tales como CPAN. CPAN no es más que el “Comprehensive Perl Archive Network”, básicamente constituye un repositorio de miles, casi 20000 modulos escritos en PERL y su documentación asociada.
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El uso de PERL en Bioinformática.

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Por Rubén Fernández
Un amigo me ha preguntado la razón del uso predominante del lenguaje de programación PERL en el área de la bioinformática. El es fundamentalmente un biólogo dedicado a la preservación de la biodiversidad, pero está familiarizado a este punto con los bioinformáticos y el uso de sus herramientas. En definitiva hay tantos lenguages de programación poderosos y versátiles que él conoce de referencia, el hecho de que PERL es tan especial para la bioinformática, es básicamente su pregunta. Bueno, PERL es tan popular con los bioinformáticos porque es magnífico a la hora de resolver tareas bioinformáticas. Ya sé que esa es la respuesta mas trivial que se puede ofrecer por excelencia a esta pregunta, pero esto no será lo último que hablemos de PERL en este posting.
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